在日本注冊(cè)公司后，涉及到的主要稅種包括：

企業(yè)稅（法人稅）：日本的企業(yè)稅是對(duì)日本公司的所得利潤(rùn)征收的一種稅種，稅率為15.6%。

消費(fèi)稅：消費(fèi)稅是對(duì)商品和服務(wù)的銷售額征收的一種稅種，目前稅率為10%。

所得稅：所得稅是對(duì)個(gè)人或企業(yè)所得收入征收的一種稅種，對(duì)于日本公司而言，主要是針對(duì)董事、股東等個(gè)人所得而征收。

地方稅：地方稅是由日本各個(gè)地方征收的稅種，包括市町村民稅、都道府縣民稅、事業(yè)稅等。

社會(huì)保險(xiǎn)費(fèi)：在日本，企業(yè)還需要繳納社會(huì)保險(xiǎn)費(fèi)，包括健康保險(xiǎn)、厚生年金、雇用保險(xiǎn)等。

需要注意的是，在日本，涉及到的稅種還包括許多其他的稅種和費(fèi)用，如地方教育稅、國(guó)土開發(fā)稅、事業(yè)振興金等，具體情況需要根據(jù)日本公司經(jīng)營(yíng)的行業(yè)和所在地區(qū)而定。