部分破壞蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),使物質(zhì)組分之間實(shí)現(xiàn)分離,這在皮革、絲綢等含蛋白質(zhì)豐富的材料加工時(shí)十分有效,部分破壞蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),使物質(zhì)組分之間實(shí)現(xiàn)分離,這在皮革、絲綢等含蛋白質(zhì)豐富的材料加工時(shí)十分有效,

果膠酶是水果加工中重要的酶，應(yīng)用果膠酶處理破碎果實(shí)，可加速果汁過濾，促進(jìn)澄清等。應(yīng)用其他的酶與果膠酶共同使用，其效果更加明顯，如秦藍(lán)等采用果膠酶和纖維素酶的復(fù)合酶系制取南瓜汁，大大提高了南瓜的出汁率和南瓜汁的穩(wěn)定性。

并通過掃描電子顯微鏡觀察南瓜果肉細(xì)胞的超微結(jié)構(gòu)，顯示出單一果膠酶制劑或纖維素酶制劑對南瓜果肉細(xì)胞壁的破壞作用遠(yuǎn)不如復(fù)合酶系。又如張倩等提出了一種新型果蔬加工酶—粥化酶（含有果膠酶、纖維素酶、半纖維素酶及蛋白酶等），可提高果蔬果汁的出汁率，增加澄清度，在果蔬加工中有廣闊的應(yīng)用前景。