黃蠟石的原巖均為硅質(zhì)巖,各種原巖受到構(gòu)造變動、火山活動、熱液作用等影響,產(chǎn)生復(fù)雜的物理和化學(xué)變化,包括重結(jié)晶、熱變質(zhì)等

礦物成分及結(jié)構(gòu)構(gòu)造的變化,后受構(gòu)造變動的影響,巖石露出地表,與地表酸性土壤環(huán)境長期接觸,或在溪流中長期磨蝕,經(jīng)歷染色、磨圓,形成河谷中的籽料。
氧化作用、交代作用和浸潤作用則形成多種色彩,如鐵的氧化和三價鐵的長期滲透、浸染,使黃蠟石呈現(xiàn)出典雅的黃色。