醫(yī)院污水處理是指處理醫(yī)院排放的污水的處理方式。醫(yī)院的污水，除一般生活污水外，還含有化學(xué)物質(zhì)、放射性廢水和病原體。因此，經(jīng)過(guò)處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來(lái)的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無(wú)集中式污水處理設(shè)備的醫(yī)院，對(duì)有傳染性的糞便，單消毒使其無(wú)害化。常用消毒劑有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對(duì)含放射性同位素的污水，應(yīng)按同位素處理要求處理。醫(yī)院污水在處理過(guò)程中，沉淀的污泥含有大量的細(xì)菌、病毒和寄生蟲(chóng)卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

傳染病醫(yī)院的污水和糞便宜分別收集。生活污水直接進(jìn)入預(yù)消毒池進(jìn)行消毒處理后進(jìn)入調(diào)節(jié)池，病人的糞便應(yīng)先立消毒后，通過(guò)下水道進(jìn)入化糞池或單處理（如虛線所示）。各構(gòu)筑物須在密閉的環(huán)境中運(yùn)行，通過(guò)統(tǒng)一的通風(fēng)系統(tǒng)進(jìn)行換氣，廢氣通過(guò)消毒后排放，消毒可采用紫外線消毒系統(tǒng) 好氧生化處理單元去除CODcr、BOD5等有機(jī)污染物，好氧生化處理可選擇接觸氧化、活性污泥和好氧處理工藝，如膜生物反應(yīng)器、曝氣生物濾池等工藝。采用具有過(guò)濾功能的好氧處理工藝，可以降低懸浮物濃度，有利于后續(xù)消毒。 適用于傳染病醫(yī)院(包括帶傳染病房的綜合醫(yī)院)和排入自然水體的綜合醫(yī)院處理。

根據(jù)國(guó)家環(huán)保總局的有關(guān)規(guī)定（國(guó)家環(huán)?？偩?醫(yī)院污水處理技術(shù)指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號(hào) ），將各類(lèi)醫(yī)院按性質(zhì)分為綜合醫(yī)院和傳染病醫(yī)院兩類(lèi)，與衛(wèi)生系統(tǒng)對(duì)醫(yī)院及醫(yī)療機(jī)構(gòu)的劃分方法有差別。其中傳染病醫(yī)院指?jìng)魅拘约膊?zhuān)科醫(yī)院和帶傳染病房的綜合醫(yī)院，綜合醫(yī)院為不帶傳染病房的綜合醫(yī)院和各類(lèi)非傳染性疾病的專(zhuān)科醫(yī)院。醫(yī)院污水凈化包括綜合醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院、民族醫(yī)院和專(zhuān)科醫(yī)院（傳染病醫(yī)院（包括結(jié)核病院）、心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、口腔醫(yī)院、婦產(chǎn)科醫(yī)院和精神病醫(yī)院等等）各類(lèi)醫(yī)院污水的處理，同時(shí)也包括療養(yǎng)院、康復(fù)醫(yī)院等其它醫(yī)療機(jī)構(gòu)和獸醫(yī)院的污水處理工程。